Если Вы работаете на предприятии, логично, что именно Ваше предприятие и внедрит результаты Вашей работы!

Чушь какая. А для чего форум-то создан? Или у вас редкая отрасль науки?

ТС работает в НИИ, насколько я понимаю. Если результатом работы является что-то для промышленного предприятия, то ни странно это внедрять в НИИ?

Добавлено через 51 секунду
Воот! Отрасль не редкая, говорит.

Тут два фактора:
1. В процесс производства в самом НИИ можно внедрять результаты исследования. Тут нужно смотреть, что производит НИИ.
2. Если НИИ разрабатывало некую вундервафлю для пром. предприятия (о которой написано в диссертации) - за справкой о внедрении нужно обращаться на пром. предприятие. Как альтернатива, и тут НИИ может выписать справку о внедрении, мол, товарищ В.И. Умников, работая по договору с ООО "Кушвинский лес", изобрёл альтернативный способ вырубки леса, что подтверждается актом приёмки-сдачи работ.

У нас обычно дело заканчивалось написанием акта об изготовлении опытной партии/образца

Может. Вы же это ТАМ внедряли, а не где-то еще.

Тут запутались немножко: отзыв на дис. работу должны давать оппоненты и чем дальше они от соискателя тем лучше, еще есть отзыв ведущей организации и это тоже внешний отзыв.
О внедрении дается акт о внедрении результатов и реально от той организации, где оно и внедрилось. Я так понимаю, речь идет не о курсе лекций по философии и о чем-то практическом - химии или экономике.
Тем более, если это не учебное заведение, где Вы учитесь и защищаетесь - тогда вообще не вижу повода для сомнений...