Если Вы в тексте упомяните, например (я на свой лад, так как в инженерии ни фига не соображаю), согласно данным избирательной комиссии, во всех округах явка избирателей составляла от 50 до 70%. Эти данные отражает сводная таблица итогов голосования в Приложении 1.
Все, ссылка есть.
По поводу точек. Точка не ставится после названия таблицы и после слова Приложение А. Точка ставится только в случае, если у Вас есть продолжение этой таблицы. Например, "Приложение А. Продолжение". А вот после слова ПРОДОЛЖЕНИЕ точку ставить не нужно.

Понятно, значит последнее слово в строке без точки :)
А насчёт приложений, там всё больше фотографий, аэрофотосъёмок и т.п. Картинок много, порядка 30, если все вместе. И всё имеют разные номера и названия. Вот меня и интересует, надо ли ссылаться индивидуально на каждый рисунок, или можно ограничится одной ссылкой на группу рисунков. Например, кадры аэрофотосъёмки (см. рис. А.1 - рис. А.14 приложения А). Не расписывая в тексте что значит каждый (под ними в приложении и так подписи есть).
Ибо если описывать, что за кусты на каждом кадре, никакой диссертации не хватит. Да и так понятно, что там за кусты и зачем нужны.

Сгруппируйте все рисунки по какому-либо признаку и делайте ссылку на группу рисунков, если у Вас в тексте так получится. :)

А считается ли ссылкой на элемент приложение (рисунок) ссылка из заключения?

Нет. Заключение - это еще не приложения. Это еще, можно сказать, текст диссертации.

И всё-таки о порядке приложений.
После очередного форматирования дисера у меня получилось так, что ссылки на элементы приложения "В" во 2 главе, а приложения "А" и "Б" упоминаются в четвёртой.
Приложение "Г" поделили 1 и 4 главы.
Это нормально или надо перенумеровывать приложения в порядке их упоминания?..

Нет, Вы что, надо по порядку. А то как так? По тексту сначала Г, потом В, потом А, Б. Так не пойдет, я думаю, что надо переделать Только порядок перечисления приложений. То есть вместо Г сделать А и так далее.

Ну, в этом случае и упоминание рисунков в приложениях надо делать по порядку, но это ж убьёшься...
Во-первых долго, во-2 элементарно не экономично с точки зрения листов - не получится оптимально скомпоновать рисунки.

А никого не волнует как Вам удобно компоновать рисунки! И сколько бумаги Вы затратили. меня тоже не везде все экономично. У меня много таблиц по избирательным округам, так я тоже их переделывала по порядку. И что, долго мучилась с тем, как сделать так, чтобы было все компактно, но потом плюнула.
Не жалейте времени. лучше сейчас сделать, чтобы потом не пришлось уже после экспертного совета править.

Да мне не жалко бумагу. У меня дисер 210 страниц с приложениями (приложений 15 страниц). Неделю сушил, ужал до 203 :(