Если это возможно - поделитесь примерным вариантом, пожалуйста!

Отличия протокола от стенограммы в принципе понятно: стенограмма дословно воспроизводит происходящее, в протоколе допустимы сокращения. Напр. "В прениях выступили проф. Сидоров, Иванов, Петров, отметившие...."
То есть это более сжатая форма по сравнению со стенограммой

Как-то так (пункты - Положение о диссовете):
П. 37 целиком
П. 38 целиком
П. 39 в схеме
- соискатель докладывает содержание
- были заданы вопросы. Вопросы задавали:
- были даны исчерпывающие ответы
- Председатель: кто за то, чтобы объявить технический перерыв? Объявляется перерыв.
- слово НР
- оглашаются отзывы (по тексту п. 39)
- слово соискателю (п. 39)
- выступление 1-го оппонента
- выступление 2-го оппонента
- слово соискателю
- В дискуссии приняли участие: .... Выступавшие отметили высокий научный уровень, соответствие специальности, и т.п.
- Предложен состав счетной комиссии. Результаты голосования:
- Счетная комиссия огласила протокол заседания. За - , против -, недействительные бюллетени - . Результаты голосования.
- Совет обсудил и утвердил заключение. Результаты голосования.

Зачем делать лишнюю работу, если можно стенограмму обозвать протоколом и не парить мозги. Поменяли "шапку" и вложили во второй экземпляр АД.

Большое спасибо, Олег Яковлевич!

Согласно п. 43 во второй экземпляр аттестационного дела, помимо вторых экземпляров или копий документов, предусмотренных в п. 42, входят след. док.... Соответственно это и стенограмма и протокол заседания ДС при защите диссертации.