Теперь, конкретный ответ на конкретный вопрос:
Дело в том, что предыдущее положение о ВАКе, было утверждено приказом Минобрнауки №177 от 3.07.2006 г. Новое положение о ВАКе утверждено Постановлением Правительства РФ и вступило в действие 5.07.2011. Так как Постановление Правительства имеет более высокую юридическую силу, чем приказ Минобрнауки, то на момент вступления в силу данного положения, руководствоваться необходимо им, а не приказом. В связи с тем, что имелось два действующих нормативных акта с разным приоритетом, Минобрнауки издает приказ о признании утратившим силу своего приказа, как имевшего более низкий приоритет в иерархии нормативно-правовых актов. Но это не означает, что постановление правительства №474 (положение о ВАК) стало действовать лишь после отмены приказ Минобрнауки №177 от 3.07.2006 г., оно действует с 5.07.2011. Минобрнауки всего лишь привел в соответствие с Постановлением Правительства свою нормативную базу, т.е. приказы, которые являются подзаконными актами по отношению Постановлениям Правительства. И это нормальная юридическая практика. Поэтому вы заблуждаетесь, относительно того что Постановление Правительства №474 стало действовать лишь после отмены приказа Минобрнауки, оно как имеющее более высокий юридический приоритет действует с 5.07.2011 г. Это, конечно, юридические тонкости. Поэтому у меня следующий вопрос, а как данное положение о ВАК, касается деятельности диссовета и в частности, прошедших защит, ведь этот процесс регламентируется Постановлением Правительства РФ №475, которое также вступило в силу 5.07.2011 и не требует дополнительных приказов Минобрнауки. Положение о ВАК в большей степени касается самой ВАК, нежели процесса защит.

1. В каком смысле что делать? Аттестационные дела уже отправлены или оформляются? Уточните, пожалуйста.

2. Сайт находился в ведении Рособрнадзора и, к сожалению, взять и тут же разместить новую информацию было невозможно...

4. Вы говорите про разные вещи. Создание Департамента - следствие изменений в Положении. Одновременно эти два факта случиться не могли.

Поверьте, руководство и рядовые сотрудники делают всё возможное, чтобы избежать страданий ни в чём не повинных диссертантов, несмотря на "эвакуационные" условия. Часть сотрудников уже переезжает, поэтому некоторые телефоны не отвечают.

Приказ появился на свет 18 июля, до 14 сентября он проходил экспертизу в Минюсте, где был зарегистрирован 14 сентября, опубликован 21 сентября и вступил в силу через 10 дней, т.е. 1 октября. Данный приказ является, техническим и погоду не делает, так как он ликвидирует противоречие с Постановлением Правительства РФ №474 вступившим в силу 5.07.2011. Приведение нормативной базы министерств в связи со вступившими в законную силу нормативно-правовыми актами, имеющими более высокую юридическую силу, как, например, Постановления Правительства РФ, нормальная юридическая практика. Она лишь упорядочивает законодательства, но никак не отдаляет вступление в силу нормативно-правовых актов с более высоким юридическим приоритетом. Так что Постановление Правительства РФ №474 действует с 5.07.2011

Правильный вопрос!

У меня тут напрашивается вопрос, а должен ли измениться персональный состав Высшей аттестационной комиссии в связи с вступлением в действия нового положения о ней самой?

Кстати - любопытно. Насколько мне известно, далеко не все приказы министерства регистрируются в минюсте. Видимо, есть какие-то типы документов, которые должны регистрироваться?

Регистрируются не все, а экспертизу проходят все. В регистрации в Минюсте нуждаются приказы, затрагивающие права, свободы и обязанности человека и гражданина, они-то и проходят более долгую экспертизу и вступают в силу после регистрации в Минюсте и через 10 дней после опубликования в Российской газете.
Приказы не затрагивающие права, свободы и обязанности человека и гражданина, вступают в силу сразу же после признаниях Минюстом не нуждающимися в регистрации и этот процесс происходит гораздо быстрее, чем первый вариант.

См. ПП РФ от 13 августа 1997 г. N 1009
ОБ УТВЕРЖДЕНИИ ПРАВИЛ ПОДГОТОВКИ НОРМАТИВНЫХ
ПРАВОВЫХ АКТОВ ФЕДЕРАЛЬНЫХ ОРГАНОВ ИСПОЛНИТЕЛЬНОЙ
ВЛАСТИ И ИХ ГОСУДАРСТВЕННОЙ РЕГИСТРАЦИИ
Добавлено через 8 минут
В Минюсте?
А ссылку не дадите?

Нет не в Минюсте, а в юридическом управлении федерального органа госвласти.
Он решает направлять или нет НПА на регистрацию в Минюст согласно п. 12
ПРИКАЗА МИНЮСТА от 4 мая 2007 г. N 88 ОБ УТВЕРЖДЕНИИ РАЗЪЯСНЕНИЙ
О ПРИМЕНЕНИИ ПРАВИЛ ПОДГОТОВКИ НОРМАТИВНЫХ ПРАВОВЫХ
АКТОВ ФЕДЕРАЛЬНЫХ ОРГАНОВ ИСПОЛНИТЕЛЬНОЙ ВЛАСТИ
И ИХ ГОСУДАРСТВЕННОЙ РЕГИСТРАЦИИ
Точно не направляют Минюст следующие акты:
п.15. Не подлежат представлению на государственную регистрацию:
а) индивидуальные правовые акты;
- персонального характера (о назначении или освобождении от должности, о поощрении или наложении взыскания и т.п.);
- действие которых исчерпывается однократным применением;
- срок действия которых истек;
- оперативно-распорядительного характера (разовые поручения);
б) акты, которыми решения вышестоящих государственных органов доводятся до сведения органов и организаций системы федерального органа исполнительной власти;
в) акты, направленные на организацию исполнения решений вышестоящих органов или собственных решений федеральных органов исполнительной власти и не содержащие новых правовых норм;
г) технические акты (ГОСТы, СНиПы, тарифно-квалификационные справочники, формы статистического наблюдения и т.п.), если они не содержат нормативных предписаний;
д) акты рекомендательного характера;
е) в соответствии со "статьей 7" Федерального закона от 10 июля 2002 г. N 86-ФЗ "О Центральном банке Российской Федерации (Банке России)" нормативные акты Банка России, устанавливающие:
курсы иностранных валют по отношению к рублю;
изменение процентных ставок;
размер резервных требований;
размеры обязательных нормативов для кредитных организаций и банковских групп;
прямые количественные ограничения;
правила бухгалтерского учета и отчетности для Банка России;
порядок обеспечения функционирования системы Банка России.

Может получится так, что минюст посчитает НПА не нуждающимся в госрегистрации, тогда
см. п.25. Акт, признанный Министерством юстиции Российской Федерации не нуждающимся в государственной регистрации, подлежит опубликованию в порядке, определяемом федеральным органом исполнительной власти, утвердившим акт. При этом порядок вступления данного акта в силу также определяется федеральным органом исполнительной власти, издавшим акт.

Не так. Правильно сказать только те, которые подлежат гос.регистрации согласно ПП РФ от 13 августа 1997 г. N 1009.