Ворд в отношении сносок довольно своенравен и его "автоматические" настройки иной раз трудно побороть, особенно как раз в том случае, если сносок на странице много и они объемные.
Гляньте, у Вас после добавления сносок собственно кусок текста с знаками сносок, которые "после десятой почему-то идет первая" сами по себе на следующую страницу не переехали?
Или у Вас в тексте номер сноски такой
12
----
1. А внизу страницы такой, т.е. под другим номером?
Если да, то попробуйте, что ли, сделать
сброс нумерации сносок.