Как ваковская она будет, безусловно, засчитана - просто потому, что журнал ваковский. А вот будет ли она засчитана как ваковская при защите Вашей диссертации - есть маленькие (действительно маленькие) сомнения. Чаще всего диссоветы рубрики журналов не сверяют, но если попадется особо дотошный секретарь совета (такой, как Вы
), то может начать задавать вопросы, и потребовать дополнительную публикацию для подстраховки