Maksimus, называется: от чего ушли, к тому пришли.
При СССР так и было: было Главное Управление войск ГО в составе МО.
Другой вопрос, конечно, пожарники.... ну очень органично будут в Минобороны.
Тогда уж - пожарников надо из ЧС выделить, и вернуть в МВД.