Насколько я помню, последние билды FineReader 9 умеют работать с djvu непосредственно.
Или поставьте виртуальный pdf-принтер и распечатайте файл в pdf.
Например PDFCreator
http://www.pdfforge.org/products/pdfcreator
PS. что касается лучшей программы для просмотра djvu файлов, это по-прежнему WinDjView (см. первое сообщение вверху этой темы). После того, как автор добавил в версии 0.5 (по сравнению с предыдущей 0.4) возможность переключения интерфейса на русский язык и поддержку закладок, она стала еще лучше.