Kravets, да, к сожалению, когда летом только появился первый вариант нового списка ВАК, Вестник ЮУрГУ (серия Вычислительная математика и информатика) в новом списке был, но в старом его не было. А спустя время, когда поданная туда статья уже получила положительную рецензию и встала в очередь, МинОбр в своем очередном приказе дал понять, что ВАК-овской моя статья будет только в том случае, если будет опубликована после 30.11.2015.
К счастью, достаточное кол-во ВАК публикаций есть, но есть шансы, что редакция немного задержит выпуск очередного номера, и тогда статья тоже будет ВАК.
Добавлено через 55 минут
Написали из ЮУрГУ, сказали, что номер выйдет после 1 декабря, т.е. статья всё же будет ВАК-овской

Очевидно, так поступят и другие журналы, присутствующие только в Новом списке.