По поводу НИР-а там просто -- там п.л. посчитаны заранее и в шапке (когда проставляется номер г.р. и инв.) они забиты.
По поводу патентов. Сам патент или свидетельство это один листик. Ну вот так, например:
1.
---
Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ "Автоматизированная система электронного обмена стандартизованными медицинскими документами"
---
Печатный
---
Свидетельство №2006614114
---
2006
---
<прочерк> (где кол-во п.л.)
---
<соавторы>
ПС: кстати полазил сейчас по интеренету, понял что у меня форма 3 не соответствовала правде.

у меня год был отдельно выделен.
У меня было так (привожу точную шапку таблицы какая у меня была, но эта шапка еще времен СССР как выяснилось, сейчас форма 3 немного другая):
№ п.п.
---
Наименование труда, открытия, изобретения
---
Печатный/Рукопись
---
Наименование издательства, журнала
---
Год издания, номер журнала
---
Количество печатных листов
---
Примечание (указать соавтора)