Как прошедший подобные условия, сообщаю: это всё грозит геморроем и мигренью - официально нифига не положено (кроме отпуска на защиту, см. ниже).
Хорошо хоть на первой работе на мои отлучки в универ не обращали внимание. Вот на второй работе всё было хуже - начальство недовольно косилось. Ладно хоть оставался всего один год и все лекции и КМ были отхожены и сданы.
PS. Попытался взять оплачиваемый отпуск на защиту (по закону положен аж на 3 месяца для КН). Пришел в кадры, потрясая протоколом принятия к защите. Кадры сказали - пока не принесешь справку-вызов с универа - фиг а не отпуск. В универе на запрос справки удивленно сделали бровки домиком и изумились "так ты, очник, еще и работаешь, собака сутулая?!". Справку один фиг не дали, типа очникам не положено. Пришлось брать за свой счет день на защиту и неделю на беганье с бумажками после защиты