Да, могут ставить такие требования, как наличие подписи (и печати) на каждой странице.
См. например, здесь вариант требований к оформлению документов одного из диссоветов, пункт 8:
http://www.ipa.nw.ru/diss_sov/subm.htm
Видимо, Вам придется делать как сказали.