Могу к списку Ink добавить ещё
http://urss.ru/. Цены приемлемые. Основной плюс - очень большой выбор литературы.
В наличии бывают и редкие книги и букинистические (говорю про математику, как с другими областями не знаю), их правда иногда приходися ждать пару недель. Есть литература на иностранных языках.