НИЦ, так же как и Научно-технический центр (НТЦ) могут быть ведущими организациями,
т.к. занимаются непосредственно научной работой.
В нашей отрасли часто назначаются ведущими организациями НТЦ ведущих компаний.
Но ведущей организацией не может быть та организация, где работает диссертант.
Также нельзя назначать оппонентов из данной организацией.
kirillo83, почитайте положение на сайте ВАКа:
http://vak.ed.gov.ru/ru/docs/?id4=155&i4=4
с 21 пункта и далее...