Собственно, непонятно, о каких экспертах идет речь. Диссертацию читают рецензенты - перед предзащитой, но если они их еще не написали, и предзащиты не было, кто бы разрешил печатать автореферат? Читают ее также оппоненты, но их мнение Вы совершенно не обязаны учитывать. И как член диссертационного совета оказался в числе оппонентов?
Не вижу смысла - ни малейшего. Как бы то ни было, дело сделано.
Руководитель поступил нехорошо. Его обязанность - помочь Вам, в данном случае - избежать неприятностей на защите, а он занимается совсем обратным. Если Вы и нарушили какие-то условности, то знать об этом должен был в первую очередь он, секретарь совета, и в последнюю очередь - Вы. И поторопить "эксперта" тоже следовало ему.
Как действовать - многое зависит от Ваших отношений с начальством - председателем совета, зав. кафедрой, деканом. Если они хорошие - может, поговорить с ними? Извиняться не надо, я уверен. Накалять отношения с руководителем и "экспертом", конечно, тоже. Подумайте, могли бы Вы найти понимание у начальства?