В общем случае, конечно, можно. Недалече как 2 дня назад в детском мире видели микроскоп х1200 (если не ошибаюсь), подключаемый через USB, за 4 тысячи наших деревянных всего. Глазки у меня загорелись на него.
А все зависит от Вашего конкретного микроскопа, конечно - если он поддерживает такое подключение - значит, можно, не поддерживает - значит, нельзя.
Хотя, больше десятка лет назад мы делали фотографии с самого обычного светового микроскопа, прилаживая к нему обыкновенный фотоаппарат. Никто не мешает к Вашему допотопному (если он не поддерживает подключение) приладить цифровой фотоаппарат или даже видео камеру
А вообще - из приличных сейчас такие микроскопы... ах, ах