Если посмотреть на списки "порезанных" ВАКом работ, то обращает на себя внимание то, что в основном это диссертации по экономике, юриспруденции, аграрным и архитектурно-строительным специальностям. Причем практически все - защищенные в "провинции".
Смысл отклонения работ - не борьба за чистоту науки, а демонстрация того, что в ВАК проводится какая-то экспертиза диссертаций. Выбираются работы из периферийных советов по заведомо "уязвимым" специальностям, после чего тщательно проверяются на предмет соответствия формальным требованиям. Если набирается 2-3 серьезных несоответствия, работа отклоняется. Ну и кроме того, в свете общей тенденции на укрупнение и концентрацию, есть, судя по всему, негласная установка на сокращение числа советов. Только за последние полгода были приостановлены (де факто закрыты) 30 советов:
http://vak.ed.gov.ru/ru/news/allnews/index.php?id4=1857