Подниму я тему.
Итак, Федеральное агентство по образованию в своём Информационном письме от 16 октября 2009г. №20-1535 "О предоставлении отчетной документации за второй этап 2009 года по каждому проекту в рамках аналитической ведомственной целевой программы "Развитие научного потенциала высшей школы (2009-2010 годы)" выделяет следующие
научные результаты:
1 Концепция
2 Методология
3 Теория (Теоретические основы, положения)
4 Метод, способ
5 Закономерность, зависимость
6 Модель
7 Принцип (Правило, гипотеза)
8 Научно-методический подход
9 Методика
10 Базы данных, программы, алгоритмы 
11 Анализ, обобщение (сбор данных)
12 Рекомендации, предложения
13 Иные результаты 
Само по себе расположение этих элементов весьма спорно, ну да ладно.
Методология обычно выступает как основа методики. Метод - это общий подход к изучению деятельности на основе материалистической диалектики. Тогда методика - это совокупность специальных приемов (методов).
Добавлено через 12 минут 20 секунд
Возьмём пару примеров - Концепция токсикологических исследований, методологии оценки риска, методов идентификации и количественного определения наноматериалов.
В частности, тут лично мне непонятно: то ли речь идёт об методологии оценки риска утверждённой в рамках концепции, либо же о концепции методологии оценки риска. С методами то же не всё ясно: в рамках этой концепции утверждены Методические рекомендации "Оценка безопасности наноматериалов". Методические рекомендации это что? Методика, рекомендации или метод?
Добавлено через 19 минут 59 секунд
И еще вопрос: п.8. - Научно-методический подход - в чём отличия от методики?
Добавлено через 7 минут 50 секунд
Так же мы можем наблюдать в п.4, что с точки зрения гос.органа, спор на первой странице о соотношении понятий "метод" и "способ" - бессмыслен, ибо они просто приравняли их друг к другу.
Добавлено через 18 минут 36 секунд
Концепция, на мой взгляд, это сформированная, устоявшаяся и интегрированная в научное знание система взглядов на цели, задачи и направления развития в определенной области деятельности
Добавлено через 1 минуту 40 секунд
Тогда концептуальные основы выступают предпосылкой для создания концепции
Добавлено через 2 минуты 2 секунды
Но концептуальные основы не равны теоретическим основам, так как теоретические основы - суть есть концептуальные подходы