Ну представьте себе такую ситуацию. Автор оформил во всей книге по-своему, например, ссылки или названия глав, а издатель говорит ему, чтобы он все менял. Но ведь, в принципе, данные изменения это уже вмешательство в сам текст. Да и, в принципе, какая разница издетелю, как что в книге оформлено.

Я не говорю, конечно, о ситуации, когда автор издает свой опус за свои денежки. Там как хотите, так и будет.

не путайте литературу и источник - это разные понятия.

Как какая разница? Он же деньги вкладывает! Довольно безумное предположение.

Я и имею в виду, что если автор издает за свои деньги, то получается, что в данном случае вообще никакие правила по оформление в книге не действуют?

Мне как издателю важно, чтобы были выполнены правила издательства. Не выполнены - автор вполне может обратиться в любое другое, которому все равно.

Но это, видимо, если автор не за свои деньги пишет книгу или иную работу?

Независимо от источника финансирования. Не нужно думать, что деньги отменяют правила.

Допустим, у автора в книге заглавия оформлены одним способом, а издателя это не устраивает, и автору что, придется все переделывать? А если в книге под 1000 страниц?

Ну дались Вам эти заголовки! Все начинается с содержания книги и правил подачи рукописи. Одно не отменяет другого. Ни один издатель не возьмёт книгу в издание если она ему не интересна и если нарушены правила подачи рукописи. А это гораздо больше, чем просто заголовки. Издателю может понравится рукопись и тогда он попросит переделать заголовки если они оформлены не так. А может это сделать сам.

И вообще вопрос заголовка - это уже вёрстка. Её автор сам как правило не делает. Это делает специально обученные человек. Иногда он согласуется некоторые вопросы с автором. Иногда нет.