Шер, лучше всего Вам сходить в библиотеку Вашего ВУЗа, и посмотреть диссертации по Вашей специальности. Я в свое время так и поступала, даже брала с собой фотокамеру, чтоб структуру пощелкать, и что как за чем строится
К тому же это полезное занятие может пригодиться и в плане анализа существующих тематик по Вашему направлению. Хотя на самом деле, у меня все равно получилась несколько иная форма рукописи, нежели в примерах. 1 глава - анализ проблемной области (именно анализ а не теория), постановка задачи и цели, 2 глава - предложен подход к решению задачи и способы решения. У меня сама тема связана с разработкой способов и их у меня 3, и поэтому далее 3,4 и 5 глава рассматривают каждая свой способ, его исследование, применимость на той или иной задаче и доказательство выдвинутых положений во 2 главе. Вот такая структура. Иду по технической специальности по направлению 05.11.16.